함석헌 사상의 핵심 가운데 하나인 씨ᄋᆞᆯ 사상을 연구하고 계승 발전시키기 위하여 <씨ᄋᆞᆯ 사상연구소>가 2002년에 설립되었다. 

초대 연구소, 원장으로 취임한 박재순 박사에 이어서 2007년에는 명칭을 <씨ᄋᆞᆯ사상연구원>으로 개칭하고 김영호 원장이 취임하였다. 

2010년에 김경재 교수가 연구원장으로 취임하여 순수 학술지 <함석헌 연구>를 창간하였다. 그 이후 몇 분의 원장이 바뀌면서 2023년에 김영덕 원장이 취임하여 <함석헌 연구 9>를 발간 하였고, ‘함석헌과 평화통일’이라는 주제 강연을 개최하여 그 성과물을 유튜브와 함께 2024년 <함석헌 연구 10>을 발간하였다.  

씨ᄋᆞᆯ사상연구원의 지속적인 성장과 발전을 위해 함석헌 사상의 연구 촉진을 계속할 것이며, 우수한 연구 인력을 확보하여 학술 세미나와 강연을 통해 얻어지는 성과물을 각종 언론과 출판으로 널리 전파할 것이다. 

함석헌의 씨ᄋᆞᆯ 사상은 ‘생명과 평화’ 사상에 직결되므로 이에 관한 연구와 상호 학제간 연구를 심층적으로 전개할 것이다. 그리고 발전을 위한 지속 가능한 실천적 프로그램으로 생명 사상과 한반도 평화를 지향하는 민주 시민단체와의 연대와 결속을 체계적으로 강화할 것이다.